อิสตันบูลตั้งอยู่บนช่องแคบ และช่องแคบนี่เองคือเหตุผลที่เมืองนี้มีอยู่ ช่องแคบบอสฟอรัสทอดยาวราวสามสิบกิโลเมตรจากทะเลมาร์มาราสู่ทะเลดำ และยังเป็นเส้นทางเดินเรือที่ใช้งานจริง เรือบรรทุกน้ำมัน เรือข้ามฟากประจำเมือง เรือประมง และเรือนำเที่ยวใช้ร่องน้ำเดียวกัน การล่องเรือที่นี่มีสามแบบ เรือข้ามฟากของเมืองจากเอมีเนอนูวิ่งเส้นทางยาวไปถึงอานาโดลูคาวากึใกล้ปากทะเลดำ จอดพักราวสองชั่วโมง และมีเส้นทางวนสั้นราวหนึ่งชั่วโมงครึ่ง เรือเอกชนออกจากเอมีเนอนู คาบาทาช คาราเคย และออร์ตาเคย ส่วนล่องเรือพร้อมอาหารค่ำเพิ่มดนตรีและเมนูกำหนดไว้

จากผืนน้ำจะเห็นด้านของอิสตันบูลที่สร้างขึ้นเพื่อให้มองจากน้ำ พระราชวังโดลมาบาห์เชทอดตัวตามฝั่งยุโรป มัสยิดออร์ตาเคยตั้งอยู่ใต้สะพานปี 1973 พอดี และป้อมรูเมลีฮีซาร์ที่สุลต่านเมห์เหม็ดที่สองสร้างเมื่อปี 1452 เพื่อตัดเส้นทางลำเลียงจากทะเลดำ ยังคุมจุดที่แคบที่สุดอยู่ ฝั่งตรงข้ามทางเอเชียคือพระราชวังเบย์เลอร์เบยี ระหว่างนั้นเรียงรายด้วยบ้านไม้ยาลึซึ่งเคยเป็นบ้านฤดูร้อนของตระกูลออตโตมัน หอคอยหญิงสาวตั้งอยู่บนเกาะเล็กของตัวเองนอกชายฝั่งอึสกือดาร์ อีกเส้นทางหนึ่งขึ้นไปตามโกลเดนฮอร์นถึงเอยึบ ส่วนเรือไปหมู่เกาะปรินซ์ใช้เวลาราวหนึ่งชั่วโมงครึ่ง และที่นั่นห้ามรถยนต์ส่วนตัว

ข้อควรรู้ เรือข้ามฟากของเมืองจ่ายด้วยบัตรอิสตันบูลการ์ดและถูกกว่าเรือนำเที่ยวมาก แต่วิ่งตามตารางเวลาและไม่มีคนบรรยาย หากไปเส้นทางยาว ควรเช็กรอบขากลับก่อนลงที่อานาโดลูคาวากึ รอบพระอาทิตย์ตกของเรือเอกชนเต็มก่อนเสมอ บนดาดฟ้าลมแรงแม้ในเดือนกรกฎาคม ควรพกเสื้อเพิ่มหนึ่งชั้น และเมื่อลมเหนือพัดคลื่นในช่องแคบจะสูงขึ้น ตอนจองควรถามว่ารวมรถรับส่งจากโรงแรมหรือไม่ และเรือมีดาดฟ้าชั้นบนแบบเปิดหรือเปล่า เพราะเส้นทางเดียวกันเมื่อมองผ่านกระจกห้องโดยสารปิดนั้นคุ้มค่าน้อยกว่ามาก